Descrizione attività
Studi di biologia molecolare e computazionale e di farmacogenetica su patologie neurodegenerative e neuromuscolari, forme sindromiche di ritardo mentale, autismo, epilessia. La linea si caratterizza per l'elevata interdisciplinarietà in un approccio integrativo degli aspetti analitici e sperimentali. L'identificazione di varianti genomiche avviene a diversi livelli e in relazione al tipo di patologia: dall'analisi di riarrangiamenti cromosomici alla ricerca di mutazioni associate a patologie genetiche fino all'identificazione di polimorfismi genomici associati a tratti fenotipici (includendo aspetti cognitivi, comportamentali e di farmacocinetica/farmacoresistenza). Gli studi di genetica di popolazione consentono l'identificazione preventiva di varianti sottoposte a selezione e pertanto ritenute funzionali. Lo studio dei meccanismi patogenetici implicati avviene poi mediante analisi funzionale impiegando metodiche computazionali (regolazione di trascrizione e splicing) e, sperimentalmente, mediante generazione di modelli cellulari e animali in particolare di Drosophila melanogasther.
Obiettivi Area di Ricerca
- Messa a punto di pipelines efficienti di sequenziamento NGS per l'identificazione di mutazioni/varianti in forme sindromiche di ritardo mentale, paraparesi spastiche, epilessie idiopatiche
- Delucidazione di meccanismi di degenerazione motoneuronale in paraparesi spastiche complesse ad esordio pediatrico
- Integrazione di genetica di popolazione e NGS nell'identificazione di varianti funzionali
- Identificazione del ruolo di alterazioni bioenergetiche e delle vie di clearance cellulare nelle patologie degenerative neuromuscolari
- Caratterizzazione dei processi di autofagia e neurodegenerazione in modelli drosophila per geni SLA
- Identificazione degli interattori del gene atlasina in modelli drosophila
- Implementazione di due biobanche integrate per la sindrome di Phelan-McDermid e distrofie dei cingoli derivate da mutazioni nella Calpaina 3
- Sviluppo di strumenti software per l'analisi di RNA aternative splicing (RNA-seq) e regolazione della trascrizione (CHIP-seq) e loro applicazione a patologie neuromuscolari
Topics
| Titolo | Responsabile | Polo |
|---|---|---|
| Biologia computazionale | Manuela Sironi | Lombardia |
| Citogenetica e ricerca genomica | Clara Bonaglia | Lombardia |
| Diagnostica molecolare, genetica umana | Roberto Giorda | Lombardia |
| Farmacologia Clinica e Traslazionale | Emilio Clementi | Lombardia |
| Modelli in Drosophila di malattie del motoneurone | Andrea Daga | Lombardia |
| Paraparesi spastiche ereditarie e Malattie del motoneurone dell’età pediatrica | Maria T. Bassi | Lombardia |
